한나라당 황우여 원내대표 등 여권 일각에서 '반값 등록금'을 추진하겠다고 밝힌 것에 대해 "부실 대학들을 놔둔 채 세금으로 등록금을 지원하는 것은 대학으로 장사를 하려는 일부 사학재단의 배만 불려주는 결과를 낳을 수 있다"는 우려가 나오고 있다. '반값 등록금'을 시행할 경우 학생 교육을 제대로 하지 못하는 대학들에까지 국민 세금이 투입될 수 있다는 것이다.
교과부 대학정보공시시스템 '대학알리미'에 따르면, 비(非)수도권 4년제 대학 126곳 중 정원을 채우지 못하는 곳은 65곳(51.6%)이나 된다. 수도권 대학까지 포함하면 77곳이 정원 미달이다. 입대(入隊)나 취업을 위해 휴학을 하는 학생들을 감안하더라도 이 대학들이 정상적으로 운영된다고 보기 어렵다. '반값 등록금' 정책을 시행해 이들 대학 재학생 29만8000여명에게 연간 500만원씩만 지원해도 연간 1조4900억원가량이 소요된다.